Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms