Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms