Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF7Q6Q0C0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms