Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms