Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms