Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms