Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms