Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms