Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms