Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms