Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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GEN1Q17RS7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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