Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms