Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FXNQ16595 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms