Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms