Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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GRIK5Q16478 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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GRIK5Q16478 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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