Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms