Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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