Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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