Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP4Q15650 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms