Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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