Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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