Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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