Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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