Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATXN7L3Q14CW9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms