Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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