Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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