Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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