Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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ITGB3BPQ13352 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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