Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms