Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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