Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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