Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms