Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms