Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms