Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms