Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms