Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREMQ03060 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms