Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms