Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms