Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms