Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms