Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms