Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA4P83105 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms