Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P63121 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms