Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms