Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms