Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms