Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms