Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB2P52799 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB2P52799 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNB2P52799 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms