Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms